Khai quyết toán thuế Thu nhập doanh nghiệp theo phương pháp Doanh thu – Chi phí

Khai quyết toán thuế Thu nhập doanh nghiệp theo phương pháp Doanh thu – Chi phí

Tác giả: Sài Gòn O2O

1. Tổng quan nhanh (bạn cần nhớ)

• Đối tượng: Doanh nghiệp tính thuế TNDN theo phương pháp doanh thu – chi phí.
• Kỳ nộp:
  • Quyết toán năm: chậm nhất ngày cuối cùng của tháng thứ 3 kể từ ngày kết thúc năm dương lịch/năm tài chính.
  • Giải thể, phá sản, chấm dứt, tổ chức lại: chậm nhất 45 ngày từ ngày có quyết định.
  • Tạm nộp quý: chậm nhất ngày 30 tháng đầu quý sau (kèm phân bổ cho địa bàn khác tỉnh nếu có cơ sở SX, BĐS, xổ số, thủy điện…).
• Chuyển đổi loại hình (không gồm DNNN cổ phần hóa) kế thừa toàn bộ nghĩa vụ thuế: không quyết toán đến thời điểm chuyển đổi; quyết toán khi kết thúc năm.

2. Quy trình thực hiện

2.1. Bước 1 – Lập và nộp hồ sơ

1. Chuẩn bị số liệu, lập hồ sơ quyết toán theo mẫu 03/TNDN và các phụ lục tương ứng.
2. Gửi hồ sơ đến cơ quan thuế quản lý trực tiếp:
   • Trực tiếp tại bộ phận một cửa.
   • Bưu chính.
   • Điện tử: Cổng thông tin của Cục Thuế/Dịch vụ công quốc gia/DVC Bộ, tỉnh/T-VAN → ký số → gửi hồ sơ.

Nộp điện tử: Hệ thống gửi thông báo tiếp nhận trong 15 phút. Cơ quan thuế phản hồi chấp nhận/không chấp nhận trong 01 ngày làm việc kể từ ngày trên thông báo tiếp nhận.

2.2. Bước 2 – Tiếp nhận và xử lý của cơ quan thuế

1. Hồ sơ trực tiếp/bưu chính: tiếp nhận theo quy định.
2. Hồ sơ điện tử: tiếp nhận, kiểm tra và phản hồi qua hệ thống dữ liệu của cơ quan thuế như trên.

3. Thành phần hồ sơ quyết toán

3.1. Hồ sơ bắt buộc

1. Tờ khai quyết toán TNDN (phương pháp doanh thu – chi phí) mẫu 03/TNDN (TT 80/2021/TT-BTC).
2. Báo cáo tài chính năm hoặc đến thời điểm giải thể/phá sản/chấm dứt/tổ chức lại (trừ khi pháp luật không yêu cầu).

3.2. Phụ lục theo phát sinh (TT 80/2021/TT-BTC)

1. KQKD: 03-1A/TNDN hoặc 03-1B/TNDN hoặc 03-1C/TNDN.
2. Chuyển lỗ: 03-2/TNDN.
3. Ưu đãi thuế: 03-3A/TNDN; đầu tư mở rộng: 03-3B/TNDN; lao động nữ/DTTS: 03-3C/TNDN; DN KH-CN/chuyển giao CN ưu tiên: 03-3D/TNDN.
4. Thuế đã nộp ở nước ngoài: 03-4/TNDN.
5. Chuyển nhượng BĐS: 03-5/TNDN.
6. Quỹ KH&CN: 03-6/TNDN.
7. Phân bổ thuế phải nộp theo địa bàn: 03-8/TNDN (cơ sở SX); 03-8A (BĐS); 03-8B (thủy điện); 03-8C (xổ số điện toán).
8. Bảng kê tạm nộp hoạt động BĐS thu tiền theo tiến độ: 03-9/TNDN.

3.3. Doanh nghiệp có dự án đầu tư ở nước ngoài (nếu có)

1. Bản chụp tờ khai thuế TNDN ở nước ngoài có xác nhận của NNT.
2. Chứng từ nộp thuế ở nước ngoài (bản chụp có xác nhận hoặc bản gốc xác nhận của cơ quan thuế nước ngoài/giá trị tương đương).

4. Giao dịch liên kết & hồ sơ xác định giá (Transfer Pricing)

4.1. Phạm vi áp dụng

• Thuộc đối tượng điều chỉnh của Nghị định 132/2020/NĐ-CP (đã được sửa đổi, bổ sung) và Nghị định 20/2025/NĐ-CP.

4.2. Phụ lục nộp kèm tờ khai

1. Phụ lục I (NĐ 20/2025/NĐ-CP) – Thông tin về quan hệ & giao dịch liên kết.
2. Phụ lục II – Danh mục Hồ sơ quốc gia (lưu tại DN, nộp khi được yêu cầu).
3. Phụ lục III – Danh mục Hồ sơ toàn cầu (lưu tại DN, nộp khi được yêu cầu).
4. Phụ lục IV – Báo cáo lợi nhuận liên quốc gia (CbCR):
   • Công ty mẹ tối cao tại VN có doanh thu hợp nhất ≥ 18.000 tỷ: nộp trong 12 tháng sau ngày kết thúc năm tài chính.
   • Công ty mẹ tối cao ở nước ngoài: nộp CbCR tại VN trong các trường hợp không có thỏa thuận trao đổi, đình chỉ trao đổi, hoặc được chỉ định nộp tại VN.
   • Trường hợp được ủy quyền nộp CbCR tại quốc gia khác và đáp ứng điều kiện về thỏa thuận trao đổi, NNT không phải nộp CbCR tại VN nhưng phải thông báo tên, MST và nước cư trú của công ty mẹ/tổ chức nộp thay trước hoặc vào ngày cuối năm tài chính.

4.3. Miễn kê khai/lập hồ sơ theo Điều 19 NĐ 132/2020/NĐ-CP

1. Miễn kê khai tại mục III, IV & miễn lập hồ sơ nếu chỉ giao dịch với các bên liên kết cùng chịu TNDN tại VN, cùng thuế suất, không ưu đãi trong kỳ (vẫn kê khai căn cứ miễn trừ tại mục I, II Phụ lục I).
2. Miễn lập hồ sơ (vẫn kê khai Phụ lục I) khi:
   • Doanh thu < 50 tỷ và tổng giao dịch liên kết < 30 tỷ trong kỳ; hoặc
   • Có APA và đã nộp báo cáo thường niên (phần ngoài phạm vi APA vẫn kê khai theo Điều 18); hoặc
   • Chức năng đơn giản, không sử dụng tài sản vô hình, doanh thu < 200 tỷ và đạt tỷ suất tối thiểu:
     • Phân phối ≥ 5%; Sản xuất ≥ 10%; Gia công ≥ 15%.
   • Quy tắc hạch toán riêng/không riêng doanh thu – chi phí để áp dụng đúng tỷ suất tối thiểu; nếu không áp dụng các tỷ suất này thì phải lập Hồ sơ giao dịch liên kết.

5. Kết quả, chi phí, cơ quan tiếp nhận

• Kết quả: Hồ sơ được hệ thống thuế ghi nhận, không trả kết quả riêng.
• Lệ phí: Không có.
• Cơ quan tiếp nhận: Chi cục Thuế khu vực/Đội Thuế cấp huyện theo phân cấp hiện hành.

6. Danh mục mẫu biểu cần dùng

1. 03/TNDN – Tờ khai quyết toán TNDN (phương pháp doanh thu – chi phí).
2. Các phụ lục 03-1A/1B/1C, 03-2, 03-3A/B/C/D, 03-4, 03-5, 03-6, 03-8, 03-8A, 03-8B, 03-8C, 03-9 (theo phát sinh).
3. Phụ lục I (NĐ 20/2025); Phụ lục II, III, IV (NĐ 132/2020) – giao dịch liên kết/CbCR.

7. Căn cứ pháp lý chính

1. Luật Quản lý thuế 38/2019/QH14; Luật số 56/2024/QH15 (sửa đổi, bổ sung).
2. Luật Thuế TNDN 14/2008/QH12 và văn bản hướng dẫn.
3. Nghị định 126/2020/NĐ-CP (và văn bản sửa đổi, bổ sung).
4. Nghị định 132/2020/NĐ-CP (quản lý thuế giao dịch liên kết).
5. Nghị định 20/2025/NĐ-CP (sửa đổi, bổ sung NĐ 132/2020/NĐ-CP).
6. Thông tư 80/2021/TT-BTC (hướng dẫn Nghị định 126).
7. Thông tư 19/2021/TT-BTC và Thông tư 46/2024/TT-BTC (giao dịch điện tử).

8. Mẹo thực hành để nộp “đúng – đủ – kịp thời”

1. Khóa sổ sớm: hoàn tất BCTC và đối chiếu thuế trước ngày 15 tháng 3 (đối với năm dương lịch).
2. Rà soát ưu đãi: kiểm tra điều kiện ưu đãi 03-3A/B/C/D để không bỏ sót.
3. Phân bổ địa bàn: lập 03-8/8A/8B/8C khi có phát sinh SX/BĐS/xổ số/thủy điện tại tỉnh khác.
4. Theo dõi tạm nộp quý: so sánh số quyết toán – tạm nộp, tránh thiếu tạm nộp gây tiền chậm nộp.
5. Giao dịch liên kết: đánh giá ngưỡng doanh thu/giao dịch để xem có được miễn hay phải lập hồ sơ; chuẩn bị CbCR nếu thuộc diện.